A Szabadkai Egészségházak a következő pénzügyi és könyvelői szakszolgálatokkal rendelkezik:

• bérelszámolás
  
• pénzügyi szolgálat
  
• pénztár
  
• főkönyvi könyvelőség
  
• állóalap nyilvántartás, készlet nyilvántartás
  
• költség követés, hatékonyság számolás, könyvelőségi elemzés
  
• közbeszerzés
  
• számlázás, készpénz kifizetés követés, integrált könyvelés
  

Ezen tevékenységek rendszerezése és együttes végzése révén lehetőség nyílik az üzletvitel ellenőrzésére, figyelemmel kísérésére és új lehetőségekre a tervezett és szerződéses tevékenység terén a Köztársasági Egészségügyi Biztosítópénztárral, és Szabadka Községgel, a Szabadkai Egészségházak alapítójával.

A tevékenység célja az egészségügyi statisztikai információk nyújtása, az időszakos és évi könyelőségi jelentések elemzése, külön figyelemmel egyes szegmensekre a költségelemzés és a sikeres gazdálkodás terén. A szolgáltatások számlázása és a jelentések leadása által kapcsolatba lépnek az egészségügyi és adminisztratív szolgálatok és ez hozzájárul az elsődleges egészségvédelem zavartalan működéséhez és az Egészségházon belüli különböző tevékenységek egyesítéséhez.